1999 年，她以文化部“民歌状元”称号从中国音乐学院毕业。2000 年获得第九届 CCTV 青年歌手电视大奖赛专业组民族唱法银奖。 2006 年的北京新春音乐会上演唱的一曲《忐忑》被大众熟知。2012 年凭借《忐忑》获得中国"金唱片"奖，中国金唱片奖是由中宣部批准的音像（唱片）业唯一的、具有重要影响力的大奖。

龚琳娜创建策划的“声音行动”音乐教育公益项目也落实在全国各地，致力于把中国的声音唱出来传下去。她策划的“吟唱古典诗词，留住中国声乐”专项人才培养项目获得了北京文化艺术基金、国家艺术基金的支持，旨在传承培养出了一批懂得“中国声音”声乐技巧、能够钻研中国声乐的教育和演唱的人才。她也担任了广州大学音乐舞蹈学院客座教授、贵州大学音乐学院客座教授、大理大学客座教授。

十多年以来，龚琳娜已经创作发表了近百首古诗词音乐作品，致力于中华古诗词的音乐创作与演唱。2019 年《人民日报》发表评论文章《歌手龚琳娜 大胆创新又不失中国韵味》：“龚琳娜的音乐融入古诗词中，根植传统却不囿于传统，大胆创新又不失中国韵味，在东西方音乐文化碰撞中探索中国音乐新创造。”